# 通用配置文件(common.json)
# 使用方法
公共算法参数文件（common.json）是用来定义各个检测或校准中涉及的公共的算法参数。该文件存在于parameters_files\MS15目录下。
- 如确有原因需要对参数进行校对和调整，需要安装适配当前版本的Pms Client Pro软件，安装流程在此略过
- 安装完成后连接仪器，并切换到Device->Parameters->Common
- 点击LOAD按钮读取配置文件内容后，可在右侧编辑框内进行编辑；点击Save进行保存
# _meta
meta记录一些和仪器，文件本身的基本信息
| 字段名称 | 字段说明 |
|---|---|
| _device | 仪器名称 |
| _name | 配置文件名称，对静态配置文件来说，就是static |
| _version | 软件版本号，三级模式，X.X.X |
# base_line_correction
base_line_correction记录基线校正的相关参数
| 字段名称 | 字段说明 | 备注 |
|---|---|---|
| max_base_line_width | 基线宽度最大值，即基线上方和下方的峰值之间的距离 | 默认为2000 |
| relative_pos | 相对于基线的位置 | 默认为0.1 |
# peak_picking_raw
peak_picking_raw从原始质谱数据中提取出质谱峰相关参数
| 字段名称 | 字段说明 | 备注 |
|---|---|---|
| mass_bin_pts | 最小峰间距门限 | 默认为50 |
| max_count | 最大peak数 | 默认为2000 |
| min_intensity_abs | 最低峰高绝对值，和min_intensity_rel配合使用，最低峰高度(max_peak_height)为max(max_peak_height*min_intensity_rel,min_intensity_abs) | 默认为100 |
| min_intensity_rel | 和min_intensity_abs配合使用，最低峰高度(max_peak_height)为max(max_peak_height*min_intensity_rel,min_intensity_abs) | 默认为0 |
| top_count | 总peaks的最大数量，如总数量超过top_count，仅保留前top_count的数量 | 默认为2000 |
# q_to_freq
q_to_freq记录q转换为频率信号过程的相关参数（q是马修方程里的系数，对应着交流的强度）
| 字段名称 | 字段说明 | 备注 |
|---|---|---|
| iter_number | 在傅里叶变换中使用的迭代次数 | 默认为40 |
| term_number | 在傅里叶变换中使用的项数 | 默认为20 |
# spec_chart
spec_chart记录spec_chart的相关参数
| 字段名称 | 字段说明 | 备注 |
|---|---|---|
| axisY_max_min | 在傅里叶变换中使用的迭代次数 | 默认为40 |
| max_peaks_count | 最大峰数量，如总数量超过max_peaks_count，仅保留前top_count的数量 | 默认为10 |
| min_intensity_rel | 相对最小强度的参数 |
# swift_mz_width
swift_mz_width
- automatic：是否自动更新参数，1/0
- coefs{}：相关系数
- c0
- c1
- c2
- mode：模式，piecewise_linear/staircase/poly_2/linear选其一，对应不同的evaluation函数
- mode_desc：模式描述，{linear, poly_2, piecewise_linear, staircase}
- r2：r2是指质谱的离子信号强度与时间的平方根之间的相关系数。它是用来衡量质谱数据的拟合程度和可靠性的一个指标。R2的取值范围在0到1之间，越接近1表示质谱数据的拟合程度越好，可靠性越高。
- x[]：x轴点的取值范围？
- x_desc：x轴的描述？
- y[]：y轴点的取值范围？
- y_desc：y轴的描述？