# 质谱数据管理

质谱数据管理包括质谱实验相关的所有信息

# 质谱数据组成

质谱数据库组成如下图所示。

uml diagram

# flagrate_data表

字段名称 字段功能 字段类型
id 数据ID bigint
description 描述 text
activated 是否可用 Boolean
deleted 是否删除 Boolean
created 创建时间 time stamp with time zone
updated 更新时间 time stamp with time zone
mrzfile mrz文件 Character varying
status 状态 integer
db_file 数据库文件 Character varying
db_version 数据库版本 Character varying
expected_result 期待结果 jsonb
analysis_result 实际的分析结果 jsonb
extra_info 其他信息 jsonb
case_id 测试用例ID,关联flagrate_case bigint
device_id 设备ID,关联reparo_device bigint
organization_id 组织id,关联user_organization bigint

说明: flagrate_data表用于存储数据信息

# flagrate_case表

字段名称 字段功能 字段类型
id 测试用例ID bigint
description 描述 text
activated 是否可用 Boolean
deleted 是否删除 Boolean
created 创建时间 time stamp with time zone
updated 更新时间 time stamp with time zone
sample_amount 试剂量 numeric
algorithm_data 算法数据 jsonb
algorithm_parameters 算法参数 jsonb
analysis_parameters 分析参数 jsonb
quant_methods 定量方法 jsonb
config_parameters 配置参数 jsonb
expected_result 期待结果 jsonb
cartridge_id 试剂盒ID,关联accio_cartridge bigint
eluent_id eluent id, 关联erecto_eluent bigint
matrix_id 基质id,关联erecto_matrix bigint
sample_unit_id sample_unit_id,关联erecto_unit bigint
organization_id 组织id,关联user_organization bigint

说明: flagrate_case表用于存储case信息

# flagrate_datatag表

字段名称 字段功能 字段类型
id 数据标签ID bigint
name 数据标签名称 Character varying
description 描述 text
activated 是否可用 Boolean
deleted 是否删除 Boolean
created 创建时间 time stamp with time zone
updated 更新时间 time stamp with time zone
organization_id 组织id, 关联user_organization bigint

说明: flagrate_datatag表用于关联数据标签

# flagrate_data_datatag表

字段名称 字段功能 字段类型
id ID bigint
datatag_id 标签ID,关联flagrate_datatag bigint
data_id 数据ID,关联flagrate_data bigint

说明: flagrate_data_datatag表用于关联数据和标签的关联信息

# flagrate_substance​表

字段名称 字段功能 字段类型
id substance ID bigint
description 描述 text
activated 是否可用 Boolean
deleted 是否删除 Boolean
created 创建时间 time stamp with time zone
updated 更新时间 time stamp with time zone
concentration 浓度 numeric
is_positive 是否阳性 boolean
case_id case id,关联flagrate_case bigint
compound_id compound id,关联accio_compound bigint
conc_unit_id conc_unit id, 关联erecto_concunit bigint

说明: flagrate_substance​表用于记录实验用例的参数设置

# flagrate_data_dfn_compound表

字段名称 字段功能 字段类型
id table id bigint
data_id data id, 关联flagrate_data bigint
compound_id compound id, 关联accio_compound bigint

说明: flagrate_data_dfn_compound表用于记录DDA实验的假阴结果的数据

# flagrate_data_dfp_compound表

字段名称 字段功能 字段类型
id table id bigint
data_id data id, 关联flagrate_data bigint
compound_id compound id, 关联accio_compound bigint

说明: flagrate_data_dfp_compound表用于记录DDA实验的假阳结果的数据

# flagrate_data_dtp_compound表

字段名称 字段功能 字段类型
id table id bigint
data_id data id, 关联flagrate_data bigint
compound_id compound id, 关联accio_compound bigint

说明: flagrate_data_dtp_compound表用于记录DDA实验的真阳结果的数据

# flagrate_data_tfn_compound表

字段名称 字段功能 字段类型
id table id bigint
data_id data id, 关联flagrate_data bigint
compound_id compound id, 关联accio_compound bigint

说明: flagrate_data_tfn_compound表用于记录targeted实验的假阴结果的数据

# flagrate_data_tfp_compound表

字段名称 字段功能 字段类型
id table id bigint
data_id data id, 关联flagrate_data bigint
compound_id compound id, 关联accio_compound bigint

说明: flagrate_data_tfp_compound表用于记录targeted实验的假阳结果的数据

# flagrate_data_ttp_compound表

字段名称 字段功能 字段类型
id table id bigint
data_id data id, 关联flagrate_data bigint
compound_id compound id, 关联accio_compound bigint

说明: flagrate_data_ttp_compound表用于记录targeted实验的真阳结果的数据